Узорак у пећини Сатсурблиа. (Ана Белфер-Коен) Шоља блата која је миленијумима била закопана испод пода пећине управо је открила геном древног човека.
Анализа открива трагове жене која је живела пре 25.000 година, током последњег леденог доба; и, иако не знамо много о њој, она представља значајно научно достигнуће: изводљивост идентификације древних људских популација чак и када нема костију за опоравак.
Узорак је такође дао ДНК врста вукова и бизона, које је међународни тим научника могао да стави у контекст историје њихове популације.
'Наши резултати,' писали су у свом листу , „пружају нове увиде у касноплеистоценске генетске историје ове три врсте и демонстрирају да директно секвенционирање седиментне ДНК седимента, без метода обогаћивања циља, може дати податке за цео геном који су информативни о пореклу и филогенетским односима.“
Опоравак древне ДНК обично се доста ослањао на кости и срећу. Прво, потребне су вам кости да би преживеле, и преживеле довољно нетакнутесачувати ДНКтоком много хиљада година.
Затим морате бити у могућности да их пронађете и повратите довољно генетског материјала за секвенцирање. То је мукотрпан посао, али исплатив - древна ДНК је у стању да попуни многе празнине у еволуционој историји не само људи, већ и других живота.
Међутим, многа археолошка налазишта имају више доказа о употреби хоминида него кости. Пећина Сатсурблиа у Грузији је једно такво место. Артефакти као што су камено оруђе боље преживљавају временску строгост од костију, тако да није изненађујуће. Чак и тако, пећину су користили древни људи хиљадама година, а ипак је геном само једне особе са тог места икада секвенциониран, од човека који је живео пре 15.000 година.
ДНК животне средине, која се може наћи сачувана у седименту, све више изгледа као одличан начин да се сазна више о прошлости. Депонује се у фецесу, као што смо видели кодопоравак ДНК древног медведа раније ове године, или фрагменти кости који су измрвљени у прашину.
Тако је тим научника предвођен еволуционим биологом Пером Гелабертом и археологом Роном Пинхасијем са Универзитета у Бечу у Аустрији кренуо у потрагу за еколошким ДНК у пећини Сатурблиа. Добили су шест узорака тла и пажљиво их прегледали тражећи трагове генетског материјала.
Пронашли су их у облику митохондријалне ДНК. Фрагментаран и непотпун, али, када се једном мукотрпно састави, довољан да се дају нове информације о популацијама које су некада насељавале регион.
Прво, жена. Само мали део њеног генома је пронађен, али из тога су истраживачи могли закључити да је она била члан раније непознате групе савремених људи. Та група је сада изумрла, али је допринела данашњој популацији у Европи и Азији, као што је откривено када је древни геном упоређен са садашњим људским геномима.
Геном вука такође представља раније непознату, сада изумрлу лозу, рекли су истраживачи. Ово сугерише да су се популације вукова значајно промениле и преобликовале на крају последњег леденог доба, пре око 11.000 година, при чему су лозе попут ове потпуно нестале.
Коначно, митохондријска ДНК пронађена у геному бизона може се наћи и код живих, данашњих бизона. Истраживачи су открили да је његов геном ближе повезан са европским бизоном и евроазијским бизоном него са северноамеричким бизоном - важан налаз, јер сугерише да су се две лозе разишле пре времена пећинског бизона Сатсурблиа. Према анализи тима, амерички бизон је дошао први, а раздвојио се у осталим популацијама.
Није познато да ли су три врсте живеле у пећини заједно - у овом тренутку је веома тешко сузити датирање са довољно сигурности. Поред тога, проучавање ДНК животне средине још увек има нека значајна ограничења, као што су фрагментарност било ког генетског материјала који је пронађен и велика могућност контаминације.
Ипак, ово откриће показује да, захваљујући јефтиној и приступачној технологији, копање по прљавштини може бити много јасније него што смо некада веровали да је могуће.
„Наши резултати показују да непристрасно секвенционирање древне ДНК седимента може дати податке за читав геном који су информативни о пореклу неколико таксона,“ писали су истраживачи у свом раду .
„ДНК древног седимента у читавом геному може отворити нове правце за проучавање читавих екосистема, укључујући интеракције између различитих врста и аспеката људских пракси повезаних са употребом животиња или биљака.“
Истраживање је објављено у Цуррент Биологи .